Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms