Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NLRP13Q86W25 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP13Q86W25 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP13Q86W25 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP13Q86W25 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP13Q86W25 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP13Q86W25 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP13Q86W25 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP13Q86W25 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP13Q86W25 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms