Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC23A3Q6PIS1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms