Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9aQ68FE2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9aQ68FE2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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