Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms