Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms