Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme4Q5SSW2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms