Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms