Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm12185Q5NCB2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm12185Q5NCB2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm12185Q5NCB2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms