Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm906Q3V0M1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm906Q3V0M1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm906Q3V0M1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm906Q3V0M1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm906Q3V0M1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm906Q3V0M1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms