Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf6Q3TWW8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.5 ms