Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA9Q16790 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA9Q16790 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA9Q16790 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA9Q16790 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA9Q16790 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA9Q16790 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA9Q16790 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA9Q16790 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA9Q16790 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA9Q16790 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA9Q16790 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA9Q16790 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA9Q16790 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA9Q16790 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA9Q16790 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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