Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIGQ13278 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIGQ13278 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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