Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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TRAF3Q13114 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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TRAF3Q13114 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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