Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms