Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms