Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
rp9P97762 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
rp9P97762 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
rp9P97762 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
rp9P97762 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
rp9P97762 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
rp9P97762 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
rp9P97762 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
rp9P97762 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
rp9P97762 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
rp9P97762 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
rp9P97762 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
rp9P97762 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
rp9P97762 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
rp9P97762 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
rp9P97762 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
rp9P97762 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
rp9P97762 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
rp9P97762 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
rp9P97762 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
rp9P97762 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms