Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psme1P97371 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Psme1P97371 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Psme1P97371 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Psme1P97371 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme1P97371 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Psme1P97371 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme1P97371 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms