Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1bP97358 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1bP97358 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1bP97358 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1bP97358 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf1bP97358 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1bP97358 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1bP97358 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms