Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TnikP83510 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TnikP83510 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TnikP83510 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TnikP83510 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TnikP83510 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TnikP83510 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TnikP83510 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TnikP83510 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TnikP83510 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TnikP83510 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TnikP83510 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TnikP83510 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TnikP83510 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TnikP83510 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TnikP83510 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TnikP83510 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TnikP83510 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnikP83510 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnikP83510 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TnikP83510 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TnikP83510 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TnikP83510 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnikP83510 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnikP83510 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnikP83510 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnikP83510 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnikP83510 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnikP83510 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnikP83510 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnikP83510 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnikP83510 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnikP83510 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnikP83510 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnikP83510 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnikP83510 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnikP83510 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms