Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms