Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP1P59025 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP1P59025 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP1P59025 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP1P59025 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTP1P59025 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTP1P59025 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP1P59025 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms