Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defb1P56386 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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