Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CratP47934 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CratP47934 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CratP47934 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CratP47934 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CratP47934 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CratP47934 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CratP47934 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CratP47934 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CratP47934 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CratP47934 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CratP47934 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CratP47934 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CratP47934 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CratP47934 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms