Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5cP41230 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5cP41230 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms