Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC5P28715 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms