Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms