Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.049e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.059e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-216ENST00000447863 3954 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.189e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.49e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-227ENST00000579677 3915 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.419e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-224ENST00000547146 3657 ntTSL 55.88□□□□□ -1.479e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-228ENST00000579850 3483 ntTSL 55.28□□□□□ -1.569e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-208ENST00000425406 3868 ntTSL 24.95□□□□□ -1.629e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 C2CD5-210ENST00000540703 685 ntTSL 514.5□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-209ENST00000563185 401 ntTSL 524.07■■□□□ 1.445e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-221ENST00000569388 562 ntTSL 523.89■■□□□ 1.415e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-213ENST00000564040 536 ntTSL 523.18■■□□□ 1.35e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-220ENST00000569348 567 ntTSL 422.4■■□□□ 1.185e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-214ENST00000565535 580 ntTSL 522.4■■□□□ 1.185e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-218ENST00000567743 1460 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.795e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-205ENST00000561579 728 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-215ENST00000566336 686 ntTSL 55.35□□□□□ -1.555e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NAE1-211ENST00000563253 566 ntTSL 31.34□□□□□ -2.195e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 ODAM-205ENST00000514097 680 ntTSL 56.53□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 ODAM-204ENST00000510847 605 ntTSL 33.83□□□□□ -1.83e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 ODAM-203ENST00000510709 780 ntTSL 52.57□□□□□ -23e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CP-211ENST00000489736 1756 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 PDXDC2P-NPIPB14P-204ENST00000530079 2764 ntTSL 515.39■□□□□ 0.053e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.93□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 SAMD5-202ENST00000566741 393 ntTSL 36.06□□□□□ -1.448e-8■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.768e-8■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 AL033504.1-202ENST00000432506 406 ntTSL 23.18□□□□□ -1.98e-8■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 IMMP1L-214ENST00000533921 122 ntTSL 314.13□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 HNRNPK-210ENST00000492865 528 ntTSL 23.58□□□□□ -1.841e-41■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 23e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 PMS1-211ENST00000424766 831 ntTSL 323.45■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 523.34■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 SHMT1-209ENST00000582653 879 ntTSL 322.68■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 520.51■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 320.51■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 520.3■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 BANP-214ENST00000466847 772 ntTSL 219.4■□□□□ 0.71e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KIF23-205ENST00000558346 1656 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 418.19■□□□□ 0.59e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CSNK1D-212ENST00000580061 578 ntTSL 318.19■□□□□ 0.59e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 BANP-218ENST00000481948 1730 ntTSL 1 (best)18.15■□□□□ 0.51e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 517.72■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RBBP5-203ENST00000484379 367 ntTSL 217.55■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CHORDC1-204ENST00000529402 809 ntTSL 316.33■□□□□ 0.26e-21■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RAB28-205ENST00000508274 1551 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-205ENST00000546571 899 ntTSL 415.79■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 515.36■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 515.08■□□□□ 09e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 215.08■□□□□ 09e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 08e-20■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 HPS5-202ENST00000352460 1642 ntTSL 514.82□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KIF23-213ENST00000561089 2743 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 414.32□□□□□ -0.129e-9■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 314.19□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 314.19□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TRIP12-210ENST00000453485 652 ntTSL 314.15□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CBX1-206ENST00000581003 812 ntTSL 314.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 BANP-224ENST00000565242 801 ntTSL 313.86□□□□□ -0.191e-13■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KDSR-211ENST00000591902 1011 ntTSL 213.69□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.248e-20■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CHORDC1-208ENST00000533062 575 ntTSL 412.87□□□□□ -0.356e-21■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 EDRF1-210ENST00000525358 436 ntTSL 312.43□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RBM4B-205ENST00000529195 809 ntTSL 212.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 212.01□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 211.97□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 EDRF1-203ENST00000368812 1380 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 511.36□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KDSR-205ENST00000586791 3384 ntTSL 211.3□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 YWHAE-202ENST00000466227 1377 ntTSL 511.17□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 511.04□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 411.03□□□□□ -0.642e-10■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 408.8 ms