Protein–RNA interactions for Protein: P18572

Bsg, Basigin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsgP18572 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsgP18572 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsgP18572 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsgP18572 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsgP18572 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BsgP18572 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BsgP18572 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BsgP18572 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BsgP18572 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BsgP18572 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsgP18572 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsgP18572 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsgP18572 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms