Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms