Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoP15409 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoP15409 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoP15409 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoP15409 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhoP15409 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhoP15409 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms