Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FlgP11088 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FlgP11088 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FlgP11088 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FlgP11088 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FlgP11088 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FlgP11088 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FlgP11088 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FlgP11088 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms