Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQL4O94761 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms