Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx8O88983 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx8O88983 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx8O88983 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Stx8O88983 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms