Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dll3O88516 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dll3O88516 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms