Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms