Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.332e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 ATL2-211ENST00000456736 578 ntTSL 319.09■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-212ENST00000472097 561 ntTSL 318.37■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-208ENST00000449130 526 ntTSL 317.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-209ENST00000451483 576 ntTSL 415.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-203ENST00000405384 1905 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 02e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-207ENST00000443098 775 ntTSL 512.7□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 413.49□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 29.8
DKC1O60832 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 516.13■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 29.6
DKC1O60832 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.581e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 29.5
DKC1O60832 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 29.5
DKC1O60832 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 29.5
DKC1O60832 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 29.5
DKC1O60832 CERS4-210ENST00000559490 420 ntTSL 524.13■■□□□ 1.454e-23■■■■■ 29.5
DKC1O60832 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.923e-8■■■■■ 29.5
DKC1O60832 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 29.5
DKC1O60832 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 318.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-203ENST00000442060 2686 ntTSL 515.14■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-221ENST00000515235 5540 ntTSL 29.95□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.191e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 222.94■■□□□ 1.261e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 221.77■■□□□ 1.081e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 320.56■□□□□ 0.881e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 318.59■□□□□ 0.571e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 216.3■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.74□□□□□ -2.131e-323■■■■■ 29.5
DKC1O60832 WWOX-215ENST00000569332 1856 ntTSL 226.44■■□□□ 1.821e-7■■■■■ 29.4
DKC1O60832 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 29.4
DKC1O60832 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 29.4
DKC1O60832 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 29.4
DKC1O60832 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 29.4
DKC1O60832 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 219.3■□□□□ 0.682e-10■■■■■ 29.3
DKC1O60832 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-10■■■■■ 29.3
DKC1O60832 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 29.3
DKC1O60832 AL360181.1-201ENST00000452591 184 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 29.3
DKC1O60832 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 29.3
DKC1O60832 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 24.71□□□□□ -1.662e-10■■■■■ 29.3
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DKC1O60832 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 518.19■□□□□ 0.56e-15■■■■■ 29.3
DKC1O60832 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 414.46□□□□□ -0.096e-15■■■■■ 29.3
DKC1O60832 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 223.45■■□□□ 1.348e-7■■■■■ 29.2
DKC1O60832 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.288e-7■■■■■ 29.2
DKC1O60832 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 29.2
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DKC1O60832 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 312.91□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 29.2
DKC1O60832 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 411.66□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 29.2
DKC1O60832 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.036e-6■■■■■ 29.2
DKC1O60832 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.026e-6■■■■■ 29.2
DKC1O60832 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.946e-6■■■■■ 29.2
DKC1O60832 STX16-NPEPL1-201ENST00000413559 557 ntTSL 38.29□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 29.2
DKC1O60832 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 29.1
DKC1O60832 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 29.1
DKC1O60832 ARHGAP26-203ENST00000378013 564 ntTSL 46.09□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 29.1
DKC1O60832 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 323.21■■□□□ 1.311e-61■■■■■ 29.1
DKC1O60832 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 421.12■□□□□ 0.971e-61■■■■■ 29.1
DKC1O60832 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 418.97■□□□□ 0.631e-61■■■■■ 29.1
DKC1O60832 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.491e-61■■■■■ 29.1
DKC1O60832 ACSL4-210ENST00000505855 587 ntTSL 44.85□□□□□ -1.631e-61■■■■■ 29.1
DKC1O60832 GATAD2A-210ENST00000457895 729 ntTSL 224.35■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 29.1
DKC1O60832 GATAD2A-204ENST00000417582 655 ntTSL 222.38■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 29.1
DKC1O60832 GATAD2A-213ENST00000609040 1652 ntTSL 221.15■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 29.1
DKC1O60832 GATAD2A-207ENST00000432704 570 ntTSL 420.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 29.1
DKC1O60832 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 29.1
DKC1O60832 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 29.1
DKC1O60832 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 OSBPL2-211ENST00000622332 754 ntTSL 311.26□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-207ENST00000468776 1653 ntTSL 1 (best)27.14■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-212ENST00000491164 583 ntTSL 426.53■■□□□ 1.846e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.626e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.426e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.316e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-214ENST00000478893 1056 ntTSL 219.92■□□□□ 0.787e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 519.72■□□□□ 0.757e-12■■■■■ 29
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