Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNCRIPO60506 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms