Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf5O35445 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf5O35445 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf5O35445 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf5O35445 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf5O35445 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf5O35445 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf5O35445 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms