Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACOX3O15254 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms