Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bbip1J3QMK2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbip1J3QMK2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms