Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trappc8E9PWG2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms