Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp42B2RQC2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms