Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms