Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a3A2ACT7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms