Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN11AQ9UI33 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms