Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod3Q9R0E1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms