Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc3Q9QZC1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms