Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fscn3Q9QXW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms