Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD3Q9NX63 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms